Des chercheurs de l’Université de Californie à San Diego ont utilisé l’IA pour décoder un élément de contrôle fondamental du génome : l’« initiateur » – une sorte de commutateur caché qui détermine quand et où les gènes deviennent actifs. Il est présent dans environ 60 pour cent des gènes humains.
La conclusion
L’équipe dirigée par le professeur James T. Kadonaga, chercheur diplômé Torrey Rhyne-Carrigg, a généré et analysé environ 500 000 séquences d’ADN variant en utilisant le séquençage à haut débit. Grâce à ces données, les chercheurs ont formé un modèle d’apprentissage automatique qui reconnaît de façon fiable les modèles de paire de base des initiateurs fonctionnels.
Pourquoi ça compte
Le modèle a identifié l’initiateur dans environ 60% des gènes humains – un puzzle de longue date en biologie moléculaire. La percée pourrait aider à prédire les effets des mutations nocives et permettre la conception ciblée des promoteurs synthétiques: changer les gènes avec précision pour la biotechnologie et la thérapie.
Sources : ScienceDaily, phys.org.
